Database and Motifs High-scoring Motif Occurrences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.10.0, (Release date: Wed May 21 10:35:36 2014 +1000)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE Static_Male-biased_Output/Static_Male-biased.fa
Database contains 1954 sequences, 977000 residues

MOTIFS Static_Male-biased_Output/dreme_out/dreme.xml (nucleotide)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
ATYGATY 7 ATTGATT
TRTTTR 6 TGTTTG
CAAAGKY 7 CAAAGGT
CMSAG 5 CACAG
CCWGGAA 7 CCTGGAA
CACGKG 6 CACGTG
TGGCW 5 TGGCA
AATAAAW 7 AATAAAA
CCCWCCCC 8 CCCTCCCC
TGACCTW 7 TGACCTT

Random model letter frequencies (from Static_Male-biased_Output/background):
A 0.274 C 0.227 G 0.227 T 0.274

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURRENCES
Motif Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
TGACCTW chr1 − 4651951 4651957 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 9555438 9555444 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 15867578 15867584 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 21323958 21323964 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 31051228 31051234 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 36158495 36158501 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 44853877 44853883 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 44891415 44891421 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 61698700 61698706 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 88916964 88916970 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 93317431 93317437 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 102281862 102281868 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 102447976 102447982 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 135405077 135405083 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 148164043 148164049 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 166617916 166617922 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 170309936 170309942 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 170310011 170310017 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 173387851 173387857 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 176861630 176861636 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 184517973 184517979 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 184532526 184532532 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 184688467 184688473 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 − 188508119 188508125 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr1 + 189328515 189328521 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 17019716 17019722 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 18090326 18090332 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 18090518 18090524 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 20043329 20043335 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 74757088 74757094 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 74757344 74757350 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 82707048 82707054 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 82707105 82707111 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 82707305 82707311 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 87183109 87183115 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 87970661 87970667 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 87978041 87978047 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 95240138 95240144 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 + 107882189 107882195 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 107946572 107946578 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 107946975 107946981 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 118699589 118699595 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr10 − 121906800 121906806 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 5391371 5391377 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 7715767 7715773 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 12152549 12152555 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 16689425 16689431 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 20759820 20759826 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 27874703 27874709 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 59945697 59945703 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 60675667 60675673 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 61663455 61663461 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 62223163 62223169 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 62223191 62223197 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 62223253 62223259 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 77644666 77644672 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 81313814 81313820 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 81313866 81313872 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 81824437 81824443 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 83377570 83377576 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 86388109 86388115 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 97281330 97281336 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 100700965 100700971 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 101143674 101143680 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 101204458 101204464 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 105027561 105027567 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 112937789 112937795 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 113478738 113478744 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 113478755 113478761 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 + 114544022 114544028 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr11 − 115031553 115031559 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 8542186 8542192 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 25933604 25933610 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 26485247 26485253 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 − 33374208 33374214 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 33374461 33374467 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 − 36102719 36102725 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 36102913 36102919 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 40823931 40823937 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 − 40823960 40823966 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 43536870 43536876 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 52360967 52360973 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 55462770 55462776 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 55462831 55462837 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 − 71023337 71023343 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr12 + 86683393 86683399 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 10447251 10447257 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 28200476 28200482 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 33061685 33061691 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 36418692 36418698 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 43464894 43464900 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 44423977 44423983 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 51190123 51190129 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 52286599 52286605 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 52286821 52286827 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 54929703 54929709 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 69721380 69721386 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 69721463 69721469 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 75051897 75051903 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 98601719 98601725 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 98601842 98601848 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 102646854 102646860 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 102647234 102647240 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 104076245 104076251 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 104349181 104349187 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 113078420 113078426 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 114317102 114317108 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 114339499 114339505 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 + 114890367 114890373 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr13 − 115643551 115643557 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 12698536 12698542 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 13157765 13157771 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 21137783 21137789 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 31892672 31892678 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 36498580 36498586 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 36498704 36498710 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 66340738 66340744 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 66361070 66361076 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 66642372 66642378 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 66701684 66701690 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 66701711 66701717 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 66701738 66701744 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 66751984 66751990 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 103181674 103181680 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 118149715 118149721 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 118154659 118154665 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 118154668 118154674 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 120228917 120228923 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 120230643 120230649 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 − 120665346 120665352 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr14 + 121493311 121493317 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 6171160 6171166 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 6840986 6840992 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 7197697 7197703 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 8519800 8519806 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 20930254 20930260 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 27563945 27563951 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 30993720 30993726 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 36365518 36365524 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 36516461 36516467 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 38522663 38522669 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 52998599 52998605 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 + 78378571 78378577 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr15 − 82285561 82285567 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 4395355 4395361 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 10644563 10644569 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 10644576 10644582 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 10644590 10644596 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 11404412 11404418 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 11406563 11406569 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 13774595 13774601 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 15550878 15550884 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 15910350 15910356 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 23444624 23444630 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 23996538 23996544 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 24223557 24223563 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 24238389 24238395 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 24260577 24260583 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 37901483 37901489 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 52267216 52267222 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 84746205 84746211 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 85656865 85656871 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 87691335 87691341 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 93312198 93312204 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 − 95361757 95361763 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr16 + 95361827 95361833 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 + 11229488 11229494 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 24380333 24380339 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 24380470 24380476 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 24402372 24402378 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 + 26719395 26719401 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 26743592 26743598 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 + 27773831 27773837 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 + 31618024 31618030 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 + 34069705 34069711 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 48341062 48341068 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 64994503 64994509 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr17 − 81775461 81775467 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 9503497 9503503 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12722364 12722370 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 12793968 12793974 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 12796748 12796754 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12797887 12797893 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 12800665 12800671 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 12846738 12846744 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12854606 12854612 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12861196 12861202 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12872941 12872947 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 12888410 12888416 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 13545621 13545627 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 13547593 13547599 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 13548485 13548491 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 32126240 32126246 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 39875534 39875540 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 43507123 43507129 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 43507129 43507135 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 54019901 54019907 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 54294987 54294993 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 60929745 60929751 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 64166557 64166563 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 75263249 75263255 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 76051640 76051646 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 76176371 76176377 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 + 76778350 76778356 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 81543116 81543122 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr18 − 81543311 81543317 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 4035274 4035280 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 + 20525890 20525896 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 + 20525896 20525902 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 21715757 21715763 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 22124010 22124016 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 23131779 23131785 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 + 23136850 23136856 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 + 23200441 23200447 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 + 23950360 23950366 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 33131119 33131125 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 39699488 39699494 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 44529954 44529960 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 57947756 57947762 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 59445693 59445699 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr19 − 59445820 59445826 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 4467718 4467724 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 12351491 12351497 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 12351704 12351710 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 25667404 25667410 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 50893760 50893766 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 53684442 53684448 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 61370639 61370645 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 64279388 64279394 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 69727399 69727405 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 71988366 71988372 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 71988808 71988814 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 90342107 90342113 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 118493075 118493081 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 130745152 130745158 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 131693988 131693994 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 131695136 131695142 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 145205898 145205904 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 148830851 148830857 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 154848148 154848154 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 163125482 163125488 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 163134480 163134486 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 163710688 163710694 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 − 164832456 164832462 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr2 + 168900712 168900718 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 18363641 18363647 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 18363664 18363670 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 18382178 18382184 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 32461860 32461866 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 35784191 35784197 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 43858877 43858883 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 54311644 54311650 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 54326814 54326820 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 54564855 54564861 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 69207272 69207278 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 84429895 84429901 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 85073303 85073309 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 94484185 94484191 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 94511071 94511077 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 94512481 94512487 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 96451414 96451420 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 98490471 98490477 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 98556260 98556266 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 104426724 104426730 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 107769708 107769714 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 107783283 107783289 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 111978894 111978900 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 118829122 118829128 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 121349830 121349836 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 135171481 135171487 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 138010524 138010530 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 − 142407409 142407415 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr3 + 142407745 142407751 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 32603101 32603107 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 57077767 57077773 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 62438598 62438604 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 63796415 63796421 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 80958531 80958537 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 81435395 81435401 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 87830222 87830228 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 103122826 103122832 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 104443034 104443040 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 104443170 104443176 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 104762455 104762461 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 105302135 105302141 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 107720428 107720434 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 107721783 107721789 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 107780972 107780978 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 107786937 107786943 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 107804894 107804900 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 114937735 114937741 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 114951125 114951131 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 114998858 114998864 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 123924218 123924224 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 128787855 128787861 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 134300640 134300646 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 134453197 134453203 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 134459929 134459935 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 138829292 138829298 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 139517104 139517110 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 146807395 146807401 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 150034318 150034324 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 − 152262680 152262686 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 152267213 152267219 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 152376101 152376107 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr4 + 154746297 154746303 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 38240625 38240631 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 41084756 41084762 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 41084927 41084933 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 66476009 66476015 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 87448698 87448704 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 87509935 87509941 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 89751102 89751108 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 102440122 102440128 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 105357317 105357323 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 111871295 111871301 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 124005051 124005057 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 + 135292065 135292071 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 135292159 135292165 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 140667881 140667887 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 144158406 144158412 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 147408935 147408941 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 147408942 147408948 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr5 − 152115038 152115044 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 34421883 34421889 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 34590274 34590280 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 34612780 34612786 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 35824988 35824994 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 37732144 37732150 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 51956577 51956583 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 57719228 57719234 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 58561165 58561171 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 71144154 71144160 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 85770796 85770802 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 85771043 85771049 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 86136236 86136242 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 87080014 87080020 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 98541081 98541087 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 99928475 99928481 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 118806096 118806102 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 119299055 119299061 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 119303503 119303509 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 121003920 121003926 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 124822643 124822649 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 124822691 124822697 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 134467526 134467532 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 138023325 138023331 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 138215467 138215473 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 − 139798645 139798651 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 139798771 139798777 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr6 + 139801244 139801250 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 20538092 20538098 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 25629439 25629445 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 47066441 47066447 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 49751945 49751951 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 56100769 56100775 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 70069213 70069219 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 71304557 71304563 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 77125478 77125484 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 77661895 77661901 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 96866309 96866315 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 96866407 96866413 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 105671555 105671561 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 107763306 107763312 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 114077688 114077694 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 121104510 121104516 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 137979015 137979021 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 141384883 141384889 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 141932712 141932718 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 − 141932785 141932791 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 142245042 142245048 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 147911707 147911713 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr7 + 148036606 148036612 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 11323907 11323913 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 23733734 23733740 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 26861088 26861094 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 26861146 26861152 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 26904410 26904416 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 37075766 37075772 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 37343931 37343937 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 46197417 46197423 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 46408310 46408316 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 46408570 46408576 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 46412436 46412442 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 46412696 46412702 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 62247024 62247030 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 67264419 67264425 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 75541768 75541774 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 88732979 88732985 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 97678105 97678111 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 97902129 97902135 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 101479268 101479274 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 107370682 107370688 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 + 107577593 107577599 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 107618782 107618788 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 116628443 116628449 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 116677395 116677401 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 118806424 118806430 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 118808068 118808074 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 128500291 128500297 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 128500540 128500546 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 128500591 128500597 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr8 − 130988301 130988307 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 20586076 20586082 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 24316550 24316556 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 24671398 24671404 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 31779960 31779966 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 34870893 34870899 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 47391515 47391521 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 53100682 53100688 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 61115050 61115056 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 61576176 61576182 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 61890255 61890261 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 62870476 62870482 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 76120903 76120909 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 76575806 76575812 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 79913535 79913541 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 96745124 96745130 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 99590514 99590520 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 104069542 104069548 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 110219707 110219713 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 115060698 115060704 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 116006285 116006291 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 116006473 116006479 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 + 122623187 122623193 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chr9 − 122783840 122783846 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 68584793 68584799 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX + 98844594 98844600 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 120325406 120325412 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX + 121299872 121299878 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 121304576 121304582 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 121308193 121308199 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 139337116 139337122 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX + 139534033 139534039 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX + 143707851 143707857 6.5e-05 0.287 TGACCTT
TGACCTW chrX − 160184009 160184015 6.5e-05 0.287 TGACCTT
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/share/pkg/meme/4.10.0_4/install/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc Static_Male-biased_Output/fimo_out_7 --bgfile Static_Male-biased_Output/background --motif TGACCTW Static_Male-biased_Output/dreme_out/dreme.xml Static_Male-biased_Output/Static_Male-biased.fa

Settings: 




output directory = Static_Male-biased_Output/fimo_out_7
MEME file name = Static_Male-biased_Output/dreme_out/dreme.xml
sequence file name = Static_Male-biased_Output/Static_Male-biased.fa




background file name = Static_Male-biased_Output/background
allow clobber = true
compute q-values = true




parse genomic coord. = true
text only = false
scan both strands = true




max sequence length = 250000000
output threshold = 0.0001
threshold type = p-value




max stored scores = 100000
pseudocount = 0.1
verbosity = 1




selected motif = TGACCTW

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top